Возможно, кому-нибудь информация будет полезна...
Решил проблему следующим образом -
Версия zoo - 3.1.5
131 стока в файле administrator\components\com_zoo\helpers\zoo.php
//путь по умолчанию - media/zoo/images/
//$thumbfile = $this->app->path->path('media:zoo').'/images/'.$file_info['filename'].'_'.md5($file.$width.$height).'.'.$file_info['extension'];
//свой путь - /images/jbzooimage/
$thumbfile = JPATH_ROOT . '/images/jbzooimage/'.$file_info['filename'].'_'.md5($file.$width.$height).'.'.$file_info['extension'];
Удалил файлы миниатюр из default-ной папки, после чего изображения стали отображаться корректно.