Идеи есть. Откройте файл jbcsv.php, который должен лежать по адресу:
/media/zoo/application/jbuniversal/framework/helpers/
и где-то на 84 и 85 строках внутри функции fromFile увидите separator и enclosure - разделитель и ограничитель соответственно - замените их на свои. Должно помочь.
 
 
Да есть такой файл и функция такая есть. 
 
Изменения внёс, но не сработало(
 
Вот сам код. У меня это строки 58, 59 и 88. Разделители пробовал разные. Ничего не срабатывает. Упорно туда попадает запятая.
<?php
/**
 * JBZoo App is universal Joomla CCK, application for YooTheme Zoo component
 *
 * @package     jbzoo
 * @version     2.x Pro
 * @author      JBZoo App http://jbzoo.com
 * @copyright   Copyright (C) JBZoo.com,  All rights reserved.
 * @license     http://jbzoo.com/license-pro.php JBZoo Licence
 * @coder       Denis Smetannikov <denis@jbzoo.com>
 */
// no direct access
defined('_JEXEC') or die('Restricted access');
/**
 * Class JBCSVHelper
 */
class JBCSVHelper extends AppHelper
{
    /**
     * @param $data
     * @param $file
     * @param array $maxima
     * @return bool|string
     */
    public function toFile($data, $file, array $maxima = null)
    {
        if (empty($data)) {
            return false;
        }
        // use maxima to pad arrays
        if (!empty($maxima)) {
            foreach ($maxima as $key => $num) {
                foreach (array_keys($data) as $i) {
                    $data[$i][$key] = array_pad($data[$i][$key], $num, '');
                }
            }
        }
        return $this->_createFile($data, $file);
    }
    /**
     * From file
     * @param $file
     * @param JSONData $options
     * @return array
     */
    public function fromFile($file, $options)
    {
        $lines = array();
        if (($handle = fopen($file, "r")) !== false) {
            while (($data = fgetcsv($handle, 0,
                    $options->get('separator', ';'),
                    $options->get('enclosure', '"'))
                ) !== false) {
                $lines[] = $data;
            }
            fclose($handle);
        }
        return $lines;
    }
    /**
     * From file
     * @param $file
     * @param JSONData $options
     * @param int $start
     * @param int $step
     * @return array
     */
    public function getLinesfromFile($file, $options, $start, $step)
    {
        $lines  = array();
        $finish = (int)$start + (int)$step;
        $i = 0;
        if (($handle = fopen($file, "r")) !== false) {
            while (($data = fgetcsv($handle, 0, $options->get('separator', ';'), $options->get('enclosure', '"'))) !== false) {
                $i++;
                if ($i > $finish) break;
                if ($start >= $i) continue;
                $lines[] = $data;
            }
            fclose($handle);
        }
        return $lines;
    }
    /**
     * Add header
     * @param $data
     * @return mixed
     */
    protected function _addHeader($data)
    {
        array_unshift($data, array());
        foreach ($data[1] as $key => $value) {
            $num     = is_array($value) ? count($value) : 1;
            $data[0] = array_merge($data[0], array_fill(0, max(1, $num), $key));
        }
        return $data;
    }
    /**
     * Create CSV file from $data
     * @param $data
     * @param $filename
     * @return string
     * @throws AppException
     */
    protected function _createFile($data, $filename)
    {
        $file = JPath::clean($this->app->path->path('tmp:') . "/jbzoo-export/$filename.csv");
        if (!JFile::exists($file)) {
            $data = $this->_addHeader($data);
        }
        if (($handle = fopen($file, "a")) !== false) {
            foreach ($data as $row) {
                fputcsv($handle, $this->app->data->create($row)->flattenRecursive());
            }
            fclose($handle);
        } else {
            throw new AppException(sprintf('Unable to write to file %s.', $file));
        }
        return $file;
    }
}
В приведёном выше коде, я уже заменил запятую на двоеточие. До изменений у меня там была запятая.