Как обновляться можно узнать тут

Обновляем компонент Zoo (актуальная версия 3.2.x) http://jbzoo.ru/docs/update-zoo
После обновления - cделайте переиндексацию всей базы данных и установите новый модуль


-= ВНИМАНИЕ! =-
Перед обновлением делаем обязательный бекап всего сайта!
За отсутствие актуальных бекапов, администрация JBZoo ответственности не несет!
Патч в принципе не умеет затирать контент и настройки!
Если вы верно распаковали архив, то ничего не должно пропасть.
Умный ход - это обновлять локальный или тестовый сайт, а НЕ рабочий в интернете. А только потом выливать протестированную версию в интернет. Никто не может дать вам 100% гарантии, что после таких глобальных изменений все отлично запустится. Например, может изменится дизайн!
Пожалуйста, обновляйте сайт только с помощью патча!
В эту тему пишем проблемы, которые возникли при обновлении.

Спасибо.